مراقبة الجينوميك في حالات تفشي الأمراض المعدية: دراسات الحالة والاستراتيجيات

وعندما يحدث تفشي مرض الرئوي في وحدة رعاية مكثفة، يمكن للفريق العامل أن يحدد ما إذا كانت الحالات مرتبطة أو غير متصلة بها، وهذا يتيح لأفرقة مكافحة العدوى تركيز جهود التنظيف والعزلة، وعلى سبيل المثال، فإن شبكة مكافحة الأمراض غير المعدية التابعة لـ تمنع انتشارها [FLT]:

ولا يكفي تكديس المعدات الحاسوبية وحدها، إذ أن برامج التدريب في مجال المعلومات البيولوجية أساسية، كما أن منابر مثل Galaxy توفر وصلات بينية سهلة الاستعمال لتحليل البيانات الجينية دون مهارات القيادة، كما أن هناك دورات على الإنترنت من برنامج " ستيرا " و " إيدكس " ، وبرنامج " عالم المعلومات والاتصالات " يساعد على تنمية المواهب المحلية.

تعزيز تبادل البيانات والتعاون

وقد تأخر الاستجابات العالمية في وقت مبكر من وباء COVID-19، وينبغي أن تتضمن اتفاقات المراقبة التي تم الاتفاق عليها مسبقاً بروتوكولات لتقاسم البيانات تتوازن بين الشفافية وحقوق البلدان التي تولد البيانات، وتوفر منابر مثل نظام المعلومات الجغرافية توزيعاً وتتيح لمنتجي البيانات الاحتفاظ بالتحكم في الوقت الذي تتيح فيه إجراء تحليل عالمي.() ويجري تحديث اللوائح الصحية الدولية لتشجيع تبادل البيانات الجينية في الوقت المناسب.

إدماج البيانات الوبائية والعيادية

وتزداد قوة البيانات الجينية عندما ترتبط بالبيانات الوصفية للمرضى الذين يتم الكشف عن هويتهم: العمر، وحالة التطعيم، وتاريخ السفر، ونتائجه.() ويستلزم الربط الشبكي المضموني بين البيانات وجود نظم معلومات قوية، كثيرا ما تستند إلى أدوات مفتوحة المصدر مثل نظام المعلومات الديمغرافية - 2 أو نظام REDCap.() ويتيح مجموعة البيانات مجتمعة إجراء تحليلات قوية، مثل تقدير فعالية اللقاحات ضد متغيرات محددة.

مواجهة التحدي

القيود على الموارد

وتكرار التكاليف المرتفعة - مع انخفاض ميزانيات الإجهاد في المناطق المنخفضة الموارد - فإن سلاسل الإمداد بالمفاعلات ضعيفة؛ وخلال الوباء، تتنافس البلدان على مجموعات المواد، مما يؤدي إلى عدم المساواة، ويمكن للنهج البديلة مثل التتابع المتجمع وأفرقة المورد المستهدفة أن تقلل التكاليف، ولكنها تتطلب التحقق.

الشواغل الأخلاقية والمتعلقة بالخصوصية

ويمكن أن تحدد بيانات الجيني الأفراد إذا ما ربطوا بالمعلومات الشخصية، كما يمكن أن تكشف عن تفاصيل حساسة عن حالة الميكروبيوم أو المناع، التي يتمتع بها البلد المضيف، كما أن من الضروري وضع سياسات واضحة بشأن الكشف عن البيانات والموافقة عليها والوصول إلى البيانات، ويكفل إشراك المجتمع المحلي اعتبار المراقبة منفعة عامة وليس من قبيل الإفراط في المراقبة.

نقص القوة العاملة

توجيهات المستقبل لمراقبة جينوميك

مراقبة مياه الفضلات

ويتجاوز قياس الناموسيات المعالجة بالمبيدات في مياه المجاري الحاجة إلى اختبار الأفراد، وقد اشتعل هذا النهج انتشارا مبكرا في عدة مدن قبل أن ترتفع الحالات السريرية، ويمكن أن يوفر إدماج الكائنات الحية في المياه المستعملة في المراقبة الروتينية إنذارات مبكرة فعالة من حيث التكلفة لفيروسات الجهاز التنفسي وشلل الأطفال بل وحتى جينات المقاومة المضادة للأوبئة.

التسلسل النقال ونقاط الحرير

(ب) تعد أجهزة مثل وزارة التعليم الوطني وأجهزة التتابع السريع الجديدة من شركات مثل Quantapore ] بجلب التتابع إلى مستشفيات المقاطعات ومناطق تفشي المرض، مع انخفاض الاحتياجات من الطاقة والتحليل القائم على الغيوم، يمكن أن تصبح المراقبة الجينية في الوقت الحقيقي شائعة مثل الاختبار السريع للمضادات.

الاستخبارات الفنية للمراقبة الافتراضية

ويمكن أن تُتوقع نماذج التعلم من الآلات التي يتم تدريبها على البيانات الجينية والوبائية من أي متغيرات يرجح أن تصبح مهيمنة، كما يمكن أن تُتوقع بالفعل من أدوات مثل PyR0 و EVEscape] أن تنبأ باختلالات الهروب فيما يتعلق بـ SARS-CoV-2.

تكامل صحي واحد

وكثيراً ما تقفز مسببات الأمراض الناشئة من الحيوانات، ويمكن لمراقبة الكائنات الحية البرية والماشية والحيوانات المحلية (مثلاً، مشروع الولايات المتحدة الأمريكية ((FLT:0)) أن تكشف التهديدات قبل أن تصبح حالات تفشي بشرية، كما أن نظاماً موحداً لمراقبة جينومياً صحياً سيتقاسم البيانات عبر قطاعات الصحة البشرية والحيوانية والبيئية.

الحوكمة العالمية والعدالة

ويتفاوض العالم على معاهدة للأوبئة تتضمن أحكاماً لتقاسم البيانات الجينية، ويهدف الصندوق الوبائي ] و] نظام الصحة الأحيائي التابع لمنظمة الصحة العالمية إلى ضمان تقاسم المنافع - مثل اللقاحات والتشخيصات - على نحو منصف مع البلدان التي تسهم في بيانات الرصد الجيومي.

خاتمة

وقد تحولت المراقبة الجينيــة من كيفية اكتشاف حالات تفشي الأمراض المعدية وتتبعها والتصدي لها، ومن أول تسلسلات إيبولا التي نشأت في خيمة إلى عدد أكبر من الجينوات التي تحملها أسبوعياً، فإن التكنولوجيا أثبتت قيمتها، ولكنها ليست رصاصة فضية، وتتوقف النجاح على الهياكل الأساسية القوية، والموظفين المدربين، والأطر الأخلاقية، والتعاون الدولي.