בחירת קו התאים הנכון למחקרי סרטן
מה הם קווי סרטן?
קווי תאי סרטן הם אוכלוסיות אלמוות של תאים שמקורם רקמות גידול אנושי.הם יכולים להיות מעורבים ללא הגבלת זמן בסביבות מעבדה מבוקרת, מתן משאב מתחדשים וסטנדרטי למחקר ביו-רפואי.מודלים אלה כבר היו מרכזיים בחשיפת המנגנונים המולקולריים של על-cogenesis, בדיקת יעילות סמים וקידום תרופות מותאמות אישית.עם זאת, לא כל קווי התא נוצרו שווים ו- #82; יציבות גנטית, צמיחה, קינטית, רלוונטיות לסרטן שונה, וסוגים שונים.
הצעד הקריטי לכל חוקר הוא להתאים את קו התא ו-#8217; מאפיינים עם השאלות הניסוייות שאילתו.מודל שנבחר בצורה גרועה יכולים להוביל לתוצאות מטעות, משאבים מבוזבזים, ואפילו פיגור מחדש.הבנת התכונות הליבה של קווי תאים סרטניים היא הצעד הראשון בקביעת בחירה מושכלת.
מפתחי מפתח לשקול בעת בחירת קו תאים
סוג הסרטן ו-Tissue Origin
הקריטריון הבסיסי ביותר הוא כי קו התא חייב להיווצר מסוג הסרטן תחת חקירה.לדוגמה, לימוד סרטן המעי הגס עם קו אדנוקרירצינומה ריאות (למשל, A549) יפיק נתונים לא רלוונטיים. Repositories כגון אוסף התרבות מסוג אמריקאי (ATCC) והאוסף האירופי של תרבויות תאים מאותות (ACC) יספק נתונים מפורטים שבדקו את המקור, הרקמה ואת האתר הראשי שלך.
פרופיל גנטי ומולקולי
מחקר מודרני לסרטן לעתים קרובות מכוון מוטציות ספציפיות, שינויים בעלי מספר עותקים, או ביטוי גנים של שורות תאים מ-FLT:0ATCCIRFLT:1 או FLT:2NCI-60 פאנלים של LT 3 מאופיין באופן נרחב.לדוגמה, FLT:4BRAFFLT:5 V600 הוא נפוץ במלנמלנות, כך שחוקרים BRAF1 דורש מעכבים את האסטרוגן-F2-F2x1 (FRM) כגון: 23-FD).
3.התאיות הצומחות והתנאי לתרבות
קווי תאים שונים יש זמני הכפלת נפרדים, דרישות החזקות, וקווי סרום.קווים מהירים (למשל, HeLa, הכפלת זמן - 24 שעות) נוחים למסכים עתירי מחשב, בעוד קווים איטיים עשויים להיות הכרחיים למחקרים שונים לטווח ארוך.חלק קווים גדלים בהשעיה (למשל, HL-60 ללוקמיה), בעוד אחרים הם דבקים תמיד התוספים המתאימים שלך (DMI-16).
סטטוס הכרה והכרה
Cross-contamination, במיוחד עם תאים HeLa, היא בעיה ידועה לשמצה.ועדת התא הבינלאומי (ICLAC) ממליץ על רצף קצר של ⁇ (STR) הפונה לאמת זהות קו תאים. repositories ניתן לנסח פרופילים; החוקרים צריכים להשוות את מלאים נגד הפניות אלה.
5.הסבר והוצאה לאור של נתונים
קווי תאים עם היסטוריה ארוכה של שימוש לעתים קרובות יש ספרות עשירה של נתונים פרמקולוגיים וגנומיים. MCF-7, למשל, הועסקו באלפי מחקרים בסרטן השד, מה שהופך אותו קל יותר להשוות תוצאות במעבדות.עם זאת, מעברים סידוריים יכולים להציג סחף גנטי. השתמש במניות בעלות נמוכה ממקורות אמינים ומעדיכים בכל פרסום.
תרופות רגישות ופרופיל התנגדות
אם המחקר שלך כרוך כימותרפיה או סוכנים ממוקדים, קווי תאים טרום מסך עבור רגישות בסיס חיוני.המסד נתונים NCI-60 ואת FLT:0CancerRxGeneFLT:1 משאבים לספק ריכוז מעכב למחצה (הערכים של 50 עבור מאות תרכובות. עבור מחקרים התנגדות, הוא קווים נצמדיםגניים (resistant לעומת הורה) זמינים אוספים פרטיים וציבוריים.
7 שיקולים אתיים ומקוריים
כל קווי התא צריכים לקבל בהסכמתם המודעת כראוי ותובנות מוסדיות.קווים תאים מודרניים רבים, כגון אלה מיוזמה מודלי הסרטן האנושי (HCMI), באים עם היסטוריה מפורטת של המטופל ואישורים אתיים. להימנע משימוש בקווים של הוכחה לא ברורה, כפי שהם עשויים להיות בעלי התחייבויות משפטיות או אתיות.
מלונות ב-Cypertic Cell Lines
סרטן השד
- (FLT:0)MCF-7:03FLT:1 Luminal A subtype, קולטן אסטרוגן חיובי, תגובה לטיפולים אנדוקריניים.
- (ב) .0.MDA-MB-231:Fillo:1 negative (כמו ניגוד), פולשני מאוד, המשמש לעתים קרובות במחקרי metastasis.
- (ב) ויקרא:א): ויקרא י' (ב') ויקרא (ב') ויקרא י"ד, ב') ויקרא (ב"ב) ,ב"ב).
סרטן ריאות
- (FLT:0)A549:FLT:1 תאים קטנים ריאה הקררצינומה (adenocarcincinoma), בשימוש נרחב עבור בדיקת סמים ו רעילות.
- (ב) .0.H460:BuildFLT:1 , גדול הקררצינומה תא, צמיחה מהירה, שימושית עבור דגמי xenograft.
- (ב) מוטציות EGFR T790M, קריטי ללימוד התנגדות לעיכובים הדור הראשון של EGFR.
סרטן המעי הגס
- (ב) ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇
- (ב) 0 (HCT-116: 1FLT:1 Mismatch תיקון לקוי, שיעור מוטציות גבוה, אידיאלי למחקרים גנטיים.
- (FLT:0)DLD-1: מנגנוני התנגדות רב-סמים, המשמשים לעתים קרובות במחקר טיפול משולב.
קווים נוספים
- (בלטינית:0) HeLaveFLT:1) (צוואר הרחם): קו התא האנושי העתיק ביותר, אורכי, אך חייב להיות אותנטי כדי להימנע מזיהום.
- (ב) [15] ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇
- (FLT:0)PC-3IRLT:1 (פרו-מדינה): אנדרוגן-אי תלוי, מגרור גבוה, המשמש למחקרי סרטן הערמונית מתקדמים.
בקרת איכות ותיקון איכות: צעדים בלתי ניתנים להשגה
אחד המלכודות הנפוצות ביותר במחקר סרטן הוא באמצעות קווי תאים מזוהמים או מזוהמים.מחקר ציוני דרך מעריך כי עד 36% של קווי תאים הם חצו-מחצו-משימתם של פרוטוקול אימות קפדני מגן על הנתונים שלך ואת המוניטין שלך.
- (ב) ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇
- (ב) ,0) בדיקות של מיקופלאסמה 1 (FLT:1 ), לפחות חודשי; ערכות PCR מסחריות הן רגישות ואמינה.
- (ב) [15] שינויים מורפולוגיים של מורפטור 1 (FLT:1) תחת המיקרוסקופית בשלב-השלבית.
- (ב) ,0) ,העליון של קו תאים 1FLT: 1 עם מספרי מעבר, אמצעי צמיחה ותוצאות אימות.
ההנחיות של ה-FLT:0 (הטבע פרוטוקולים) של 1:1 מספקות שיטה סטנדרטית לפרופיל ודיווח.
בחירת קווי תאים עבור מטרות ניסיוניות ספציפיות
צילום: High- Throughput Screen
עבור קמפיינים של גילוי סמים, בחר קווי צמיחה חזקים, מהירים עם פנוטיפים עקביים.הפאנל NCI-60 הוא לעתים קרובות נקודת ההתחלה. השתמש קווים מתועבים היטב עם תגובה ידועה לתרופות סטנדרטיות של טיפול.
ג'ין עריכה ו-Gemomics פונקציונלי
מחקרים CRISPR-Cas9 דורשים קווי תאים עם יעילות גבוהה וקיבולת שילוב גנומית יציבה. HCT-116 ו HEK293T (למרות שלא קו סרטן ל-S) הם פופולריים.עבור עריכת סרטן ספציפית, לשקול קווים חולניים-דרדרים מן HCMI.
Tumor Microenvironment ו-Co-Culture Models
אם המטרה היא ללמוד אינטראקציות סטריליות או ⁇ חיסונית, קווי מונוגסטרציה עשויים לא מספיק. השתמש קווים שניתן להשתמש בהם יחד עם fibroblasts או תאים חיסוניים (למשל, MDA-MB-231 עם תאים T מופעלים). חלק מהקווים מותאמים לפורמטים spheroid או איברדיואיד 3D, המספקים יותר הקשר פיזיולוגי.
מגמות מתפתחות: מודלים של מטופלים-Derived ותרבות 3D
בעוד קווים מסורתיים 2D מונוlayer נשאר את העבודה של מחקר סרטן, הם לעתים קרובות נכשלים לשחזר בביולוגיה vivo.השינוי לעבר אגואידים מאוגדים (PDOs) ו xenografts (PDXs) מציע רלוונטיות תרגום גדולה יותר. pdos לשמור על הטרוגניות genomic וארכיטקטורה של גידולים מקוריים, מה שהופך אותם חזקים עבור תרופות מותאמות אישית, הם דורשים תנאים מורכבים יותר להקרנה תרבותית פחות.
עבור מעבדות עדיין באמצעות קווים מבוססים, אימוץ פלטפורמות תרבות 3D (למשל, Matrigel הטמיע, ירידה תלולה) יכול לשפר את הערך הנבאיבי של אסימונים. מחקרים מראים כי תגובות סמים ב 3D לעתים קרובות שונה מאלה ב 2D, לפעמים מנקה טוב יותר עם תוצאות קליניות.
משאבים לבחירת קווי תאים
מספר מסדי נתונים ו-Repositories יכולים לעזור לזהות את קו התא האופטימלי לפרויקט שלך:
- מקור:0 (ATCCIRLT:1 ו-#8211; מקור סמכותי עם שירותי אימות.
- (ב) ,0) ,CancerRxGeneFLT:1 – נתונים גנומיים ורוקחים עבור 1,000 קווים.
- (FLT:0) Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)IRLT:1 ו-#8211; פרופילים רגישים גנטיים וסומטיים נרחבים.
- (ב) ויקרא:0) , ויקרא: 1 ו-#8211; מאגרי מידע מכוונים לפרסומים ולתערות זיהום.
מסקנה
בחירת קו תאים סרטני הנכון היא החלטה כי reverberates דרך כל ניסוי מטה הזרם.זה דורש היערכות זהירה עם הסוג הסרטן, רקע גנטי, התנהגות צמיחה ומעמד אימות. על ידי מינוף קווים מוכרים היטב ממקורות מכובדים ושילוב בקרת איכות מודרנית, החוקרים יכולים להגדיל את יעילות מחדש ואת הרלוונטיות הקלינית של העבודה שלהם.
להשקיע זמן באמת זהות קו תאים ומאפיינים לפני ביצוע מחקרים בקנה מידה גדול.עם המודל הנכון ביד, המחקר שלך הוא הרבה יותר צפוי לייצר תוצאות אמינות, השפעה שבסופו של דבר לטובת חולים.