Table of Contents
הקדמה: Genomics כאבן הפינה של מערכות המזון המודרניות
מערכת המזון העולמית מתמודדת עם לחץ חסר תקדים.הפרויקטים של האו"ם שעד שנת 2050, ייצור חקלאי חייב להגדיל בכ-60% להאכיל אוכלוסייה של קרוב ל-10 מיליארד, כל עוד שינויי האקלים מעצימות, הצפות וההתפרצויות המסורתיות, אשר מסתמכים על חלקיקי שליטה phenoypic על פני דורות רבים, איטיים מדי כדי לשמור על קצב עם אתגרים אלה.
genomics לתוך החקלאות הוא לא רק תרגיל אקדמי; זוהי גישה מעשית, מדרגית כי מבסס את הדור הבא של מערכות חקלאות. מחוות בעלי חיים קטנים באפריקה שמדרום לסהרה ועד לפעולות בקנה מידה גדול במערב התיכון האמריקאי, כלים גנומיים מאפשרים החלטות מושכלות יותר לגבי אילו זנים לשתול, כיצד לנהל אדמה ומים, וכיצד להגן על בעלי חיים מפני מחלות מתפתחות, כמו עלות של ריצוף, להמשיך את הנתונים המתפשטים, להמשיך ולעבורת, כמו ניתוח מתקדם יותר, הופך להיות יותר ממעבדה של ניתוח נתונים מתוחכמים יותר, הופך להיות ממעבדה, הופך להיות יותר, הופך לרמה של ניתוח נתונים של ניתוחי יותר, הופך להיות יותר, הוא מתקדם יותר, הופך להיות יותר, הוא מבטיח מחקר חדשני יותר, כמו גם יותר, הופך להיות יותר, כדי לנתח יותר, כדי לנהל אדמה יותר, כמו גם יותר, כמו גם יותר, כדי לפתח יותר, הוא מבטיח מחקר חדשני של ניתוח נתונים מתמטית יותר, הופך להיות יותר, כדי לפתח יותר, כדי לנהל אדמה ומחסין, הוא מבטיח מחקר חדשני יותר מתוחכם יותר, כדי לנהל אדמה ומחסין, כמו גם מבסיסה, כדי לנהל אדמה וממים יותר, כדי לנהל אדמה, כדי לפתח יותר, כדי לנהל אדמה, כדי לפתח יותר, כמו פיתוח,
הבנת המסגרת הגנומית בחקלאות
בליבה, genomics כרוך בריצוף, אסמלינג, וניתוח של מערך שלם של DNA - הגנום - של אורגניזם. עבור מינים חקלאיים, זה כולל גם את הגנום הגרעיני וגם, בצמחים, הגנום של chloroplasts ו- mitochondria.ההתובנות העיקריות הן רצף DNA (שלדים) בקרב אנשים אחראים במידה רבה להבדלים בתכונות כרומוזומליות (Gects) כגון תכונות מולקולריות).
שלא כמו סמנים מולקולריים מבוגרים (למשל, RFLPs, AFLPs) שהיו יקרים ונמוכים, לוחות חד-צדדיים מודרניים (SNP) וערכים של גנומיים שלמים המספקים מיליוני נקודות נתונים לדגימה. אלה nucleotide polymorphism (SNP) ו-genome sequencing לספק מיליוני נקודות נתונים באופן בו-Gre), מדדי גבוה של בחירת רמות גבוהות אלה מאפשרות לחוקרים לחשב את האופי המורכב, פוליגנוני של גנים בעלי ערך גנטי בעל ערך רב-גנטי, בהשוואה ל-גנטי, כלומר, כלומר, כלומר, כלומר, לדוגמה, כלומר, כלומר, ל-גנטי, ל-אפקטים בעלי ערך גנטי גבוה, או ל-תועלת גבוהה, או ל-גנטי, בהשוואה ל-תועלת גבוהה, בהשוואה ל-גנטי, או ל-גנטי, בעלי ערך גנטיים, בעלי ערך גנטיים, בעלי ערך גנטי, בעלי ערך גנטיים, בעלי ערך גנטיים, בהשוואה ל-גנטיים, בהשוואה ל-גנטיים, בעלי ערך גנטיים, בהשוואה ל-תועלת גבוהה, בהשוואה ל-גנטיים, בהשוואה ל-תועלת גבוהה, בהשוואה ל-תועלת גבוהה, בעלי ערך גנטיים, בעלי ערך גנטיים, בעלי ערך גנטיים, כלומר, בעלי ערך
חקלאות: מערכת אקולוגית של נתונים-Driven
החקלאות (PA) מתייחסת לשימוש בטכנולוגיית מידע, חיישנים וניתוח נתונים כדי לייעל קלטות (שרד, מים, דשן, חומרי הדברה) ברמת תת-שדה, למקסם את היעילות וצמצום ההשפעה הסביבתית. Genomics משתלב בצורה חלקה לתוך מסגרת זו על ידי מתן שכבת מודיעין ביולוגית, נתונים, ודימויים מרוחקים, המאפשרים של ירידה ברמת דיוק, ניהולית, היא בעלת מגוון רחב של חומרים מזינים, עם רמת תפקוד גנטיים, שיכולה, עם מגוון רחב של תאים, באופן עצמאי, עם רמת יכולת ניהולית, עם מגוון פונקציונליים, וגמישות, עם רמת תאים, שיכולה, וגמישות, מאפשרת גישה מתאימה, כגון, כגון, כגון, כולל של תאים גנטיים, עם שכבתיים, עם שכבתיים, עם שכבתיים, שימושית, עם שכבת ניהולית, עם שכבת ניהולית, עם שכבת ניהולית, עם שכבת ניהול לקויה, עם מגוון רחב של תאים גנטיים, עם מגוון רחב של תאים מלאכותיים, עם שכבתיים, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם שכבת חיסון, עם מגוון רחב של תאים גנטיים, ורמות היברידית תאים מלאכותיים, עם מגוון רחב של תאים מלאכותי
סינרגיה זו מרחיבה את פעולות בעלי החיים, שבו genomics מודיע משטרי האכלה אינדיבידואליים, תוכניות רבייה, והתערבות בריאות.חיישנים על צווארוןים לבישים או חלבונים ללכוד נתונים בזמן אמת על פעילות, rumination, ורכב חלב; פרופילים גנטיים ואז לחזות אילו בעלי חיים נוטים להגיב באופן חיובי לטיפול או דיאטה.
כלים וטכניקות מפתח בחקלאות
בחירת מארקר-אסד (MAS)
בחירה מבוססת מארקר משתמשת בסימנים מולקולריים המחוברים הדוקים לגנים של עניין לבחור אנשים הנושאים אללים נוחים ללא המתנה לביטוי phenotypic מלא.טכניקה זו היא חזקה במיוחד עבור תכונות שקשה או יקר למדוד - כגון אדריכלות שורש, יעילות חנקן, או התנגדות לפתוגנים רבי עוצמה נגד פסיפסים פשוטים (Falzesol) המשמשות בעיקר לטיפוסים פשוטים של מגוגנים קטנים יותר (MangSolsicial) אך ורק כדי להפחית את המולקולות).
בחירה גנטית (GS)
בחירה Genomic מייצגת קפיצת קדימה.במקום להתמקד בסמן משמעותי סטטיסטית, GS משתמש בכל הסמן (ללא משקל בגודל האפקט) כדי להכשיר מודל חיזוי על אוכלוסיית ההתייחסות של אנשים גנוטיפד ופנוטיפד, ברגע שהמודל ייושם, מועמדים לבחירה חדשה צריך רק גנוטיפד; ה-GBVs שלהם מחושבים ממודל, ומאפשרים לבחור את הטוב ביותר בתקופות של מחזור חלב רב-מי כבר יכול להיות כפול של מחזורי של תאים.
ג'ין אדיס (CRISPR-Cas9)
כלים עריכת גנים, במיוחד CRISPR-Cas9, מאפשרים שינויים מדויקים וממוקדים לדנ"א של אורגניזם, בניגוד ל-GMOs, עריכת גנים יכולה להציג שינויים שאינם ניתנים למוטציות טבעיות - כגון דפקת גן עבור זיהומים רגישים למחלות או עריכת קודר כדי להגביר את הביטוי של גן בצורת-סובלנות.
תוצאות חיפוש ב Crop שיפורים: Case Studies
כלים גנטיים מעצבים באופן פעיל תוכניות גידול על פני היבולים העיקריים.באורז, המהפכה הירוקה למחצה של הגן (FLT:0sd1FLT:1) הוא ידוע, אבל גישות גנומית כבר זיהו עשרות של הפסדים נוספים שליטה ביבולים ויראליים.המכון למחקר אורז הבינלאומי (IRRI) משתמש כעת בבחירה genomic כדי לפתח תת-סובלנות וזנים קיבוליים, בענפים קריטיים, עוזר לחקלאות, ביבולים קריטיים.
דוגמה משכנעת נוספת היא התפתחות של זנים "חכמים" חיטה בפני מתח חום. a קונסורציום בראשות אוניברסיטת נברסקה-לינקובן בשילוב לימודי התאגדות גנום עם מודלים סביבתיים כדי לאתר את כל השללים המספקים thermotolerance בפריחה. על ידי ערימה של אלה נוחים באמצעות מחזור אחורי של סמרטוט, הם יצרו קווים כי 15-20% יותר מאשר מצבים רגילים הם הופכים לשיפורים יותר מאשר טמפרטורות חום לעתים קרובות יותר.
Genomics in Livestock הפקה
יישומים גנומיים בבקר הם אולי אפילו יותר מתקדמים מאשר ביבולים, מונעים על ידי הערך הכלכלי הגבוה של בעלי חיים בודדים וקיום אוכלוסיות התייחסות חזקות. בקר חלב, המועצה על חלב Cattle Breeding (CDCB) בארצות הברית שומרת על מערכת הערכה גנטית לאומית עם GEBVs עבור תכונות כולל חלב מניבה חלב, ספירת תאים סומטיים (פרומנט למחתרת של דלקת ריאות), וחיים פרודוקטיביים של צעירים, לעומת קצבי, לעומת זאת, הם קצרים יותר, לעומת 3 גרם גבוה יותר, כמו גם עבור גלימות גנטית, כמו גם קצבי, כמו גם עבור רמות גבוהות יותר, כמו גם קצבי, כמו גם עבור גלימות גבוהה יותר, כמו גם עבור רמות גבוהות יותר.
בקר, בחירת גנומית צוברת מתחים לתכונות כגון מרבלינג (שומן פנימי), יעילות עריכת ואכילה דחיסות. מפיקים יכולים לרכוש כעת בולים צעירים עם תחזיות גנומית, צמצום הסיכון לביצועים עניים.עבור חזירות ופודורי, שבו אוכלוסיות גדולות ושיעורי מחקר רב-גבוהים, מידע גנטי משמש לניהול מגוון גנטי והתנגדות עבור מחלות, כגון HIVF3, 000) ו- HIV, אשר מזוהה כעת, כמו GLT3, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000 זה מכבר, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000 עבור כל אלה הוא מזהה את כל אלה הוא HIV, 000, 000, 000, 000, 000, 000 כדי לרפא התנגדות גנטית, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000, 000 כדי לרפא התנגדות דם
היתרונות של אבטחת המזון העולמית
השילוב של גנומיקים לחקלאות מדויקת מתייחס ישירות לכמה עמודי תווך של ביטחון המזון: זמינות, גישה, ניצול ויציבות. על ידי השגת התפתחות של זנים סובלניים ובעלי רגישות גבוהה, גנומיקים מגדילים את כמות המזון הכוללת המיוצר ליחידת אדמה, עבודה, מים, במיוחד באזורים שבהם אדמה חקלאית היא מוגבלת ואקלים הוא סובלנות גבוהה.
שיפור תזונתי, או ביופורטו, הוא יתרון ישיר נוסף.כלים הגנומיים שימשו להגברת התוכן בברזל ובאבץ ב-פנינה, Provitamin A ב casava, ו- folate אורז.תוכנית קציר פלוס התבססה על בחירה ממונה על מנת לפתח פוליחות מאומץ ברזל, שכעת גדלים על ידי מיליוני בעלי חיים קטנים ברואנדה וברפובליקה הדמוקרטית של קונגו, אשר תורמים למיקרו-תזונה גלובלית, ולהפחית את שכיחותם של אנשים בעלי חיים של מחלות מין, אשר תורמים לזיהומים של מחלות מין, אשר ממין, אשר כיום, אשר ממין, אשר ממין-תזונה, ולהפחית את שכיחות יתר על פני 2 מיליארד לקויותרפיון, אשר ממין, אשר ממין האנושי, אשר ממין, אשר ממין, אשר ממין האנושי, אשר כיום, אשר כיום, אשר כיום, אשר ממין, אשר מקטין את שכיחות יתר על ידי מיליוני אנשים בעלי מחלות מין, אשר ממין, אשר ממין-תזונה, אשר כיום, אשר ממין, אשר ממין, אשר ממין, אשר כיום גדל כיום גדל כיום, אשר ממין, אשר מקטין, אשר מתוגדילים, אשר מקטין את שכיחות יתר על ידי מיליוני אנשים בעלי מחלות מין, אשר ממין, אשר
לבסוף, גנומיקים משפרים את הקיימות והיציבות של ייצור המזון על ידי צמצום ההסתמכות על קלטות כימיות. זנים עמידים למחלות דורשות פחות פטריות ו- Bactericides, הורדת עלויות הייצור והזיהום הסביבתי.בבקר, בחירת גנומית לצמצום יעילות ההזנה של פליטות מתאן ושימוש בקרקע, תוך התאמה של נהלים חקלאיים עם מטרות אקלים קיצוניות הופכת לנפוצות יותר, לאחר זעזועים גנטיים, לאחר זעזועים שונים של מזון מהיר יותר, לאחר זעזועים.
אתגרים ושיקולים אתיים
למרות הבטחתו, אימוץ נרחב של גנומיקים בחקלאות עומד בפני מכשולים משמעותיים.העלות של גנוטיפפינג, תוך ירידה, נשאר מחסום עבור תוכניות רבייה ציבוריות במדינות בעלות הכנסה נמוכה. מערך SNP יחיד יכול לעלות 30-50 דולר לדגימה, וביטוח לאומי אטומי שלם עשוי להיות 100 דולר או יותר.עבור תוכנית טיפול בעשרות אלפי מועמדים מדי שנה, זה מוסיף במהירות את המיומנות הבסיסית של פיתוח נתונים, אך ורק כדי לנתח את הקיבולת הגנטית של קבוצות גדולות יותר.
חששות אתיים ורגולציה גם מורכבים. Gene העריכה, במיוחד, מעלה שאלות על השפעות מחוץ להשגה, השלכות בלתי צפויות על המגוון הביולוגי, והפטנט של רצפים גנטיים.נוף הפטנט CRISPR מורכב, עם כמה צדדים המחזיקים תביעות חפיפות, וזה יכול לייצב חדשנות או להוביל לשליטה מונופוליסטית של טכנולוגיות חיוניות.
המגוון הביולוגי הוא עוד דאגה.שימוש בגנומיקים להפיץ במהירות כמה זנים עילית יכול להאיץ את שחיקה גנטית, צמצום וריאציות שעומדות המספקות חיץ נגד לחצים עתידיים. Ex situ שימור בבנקים גנים ובשמירת השבה באמצעות תוכניות גידול השתתפותיות חייב ללוות מאמצים רב-גנטיים.הנציבות FAO על משאבים גנטיים למזון וחקלאות מדגישה את הצורך לשלב גנטיקה עם אסטרטגיות שימור פוטנציאליות של שימור מיניים כדי להתאים את המין החקלאי.
כיוונים עתידיים: דבקות של Genomics וחקלאות דיגיטלית
במבט קדימה, ההתכנסות של genomics עם טכנולוגיות דיגיטליות אחרות יפתחו אפילו דיוק גדול יותר. אלגוריתמי למידת מכונות יכולים עכשיו לחזות פנוטיפ מ genotype עם דיוק גדל, המאפשר "תאומים דיגיטליים" של גידולים שדמיינו צמיחה תחת תרחישים ניהול שונים. Drones ולוויינים מצוידים עם חיישנים היפר-ספקטרום יכול לזהות הבדלים עדינים בפיזיולוגיה צמחית כי עם גנטיקה מסוימת, המאפשרת לדלקת לא פולשנית של הבקבוק, אשר לא פולשנית באופן היסטורי, אשר היה להפחית את הפחתת הגדלה.
גבול נוסף הוא היישום של pangenomics. במקום להסתמך על גנום התייחסות יחיד, pangenomics מקטלוג את כל סט הגנים על פני כל זנים של מינים, כולל הגנום "בלתי ניתן להשגה" אשר נמצא רק בקווים מסוימים. גישה זו חשפה כי תכונות חשובות רבות - כגון התנגדות לפתוגן המשגשג:0s grarumFreaturesarium הם נשלטים על ידי גנים גנטיים גנום קודם לכן, אשר אינם יכולים להיות נשלטים.
לבסוף, ביולוגיה סינתטית עשויה בקרוב לאפשר למדענים לעצב מסלולים מטבוליים חדשים לחלוטין ביבולים.לדוגמה, חוקרים במרכז ג'ון ונסנס העבירו בהצלחה את מסלול תיקון החנקן מגזרות לדגנים, פריצת דרך שיכולה להפחית את הצורך של דשנים חנקן סינתטיים על ידי מיליארדי טונות מדי שנה. בעוד עדיין בשלבים מוקדמים, עבודה זו מראה כי גנומים אינם רק על קוד הטבע של קריאה, אלא גם כדי לענות על הצרכים של האנושות.
מסקנה
Genomics עבר מחוד החנית של מדע בסיסי ועד ערכת הכלים הליבה של החקלאות המודרנית.על ידי מתן בחירה מדויקת ברמת ה- DNA, היא מאיצה את הפיתוח של יבולים וחיות שהם פרודוקטיביים יותר, גמישים, ומזין.כאשר בשילוב עם מערכת האקולוגית של דיוק, מידע גנטי מעצימה את החקלאים לקבל החלטות ספציפיות לאתר שמייעלות ולהפחית את הנזק הסביבתי לצריכת המזון, ולהפחית את הפחתת הפחתת הבזבוז, ולהפחית את הפחתת הבזבוז, ולהפחית את האקלים.
עם זאת, מימוש הפוטנציאל הזה דורש פעולה מכוונת.השקעות בתשתיות גנומיות, הכשרה וגישה שוויונית חייבת להיות עדיפות על ידי ממשלות, ארגונים בינלאומיים, המגזר הפרטי. מסגרות תגמול צריכות להיות שקוף וסיכון לטיפוח חדשנות תוך הגנה על המגוון הביולוגי ואמון הציבור.