การ แยก กัน อยู่ ระหว่าง กระบวนการ ต่าง ๆ จาก ห้อง ทดลอง ไป ยัง ระดับ อุตสาหกรรม นั้น ต้อง มี ข้อ ท้าทาย มาก มาย.
ออกแบบโพรเซสแบบไม่จุลภาค
การ ออก แบบ แบบ แบบ ไม่ มี ประสิทธิภาพ อาจ ทํา ให้ เกิด ความ ไม่ สะดวก, ค่า ใช้ จ่าย เพิ่ม, และ อันตราย จาก อันตราย ด้าน ความ ปลอด ภัย.
การ ละเลย ข้อ จํากัด ใน การ เก็บ เกี่ยว
การ เลือก วิธี การ ที่ ใช้ ได้ ผล จริง อาจ ไม่ ได้ ทํา กัน ใน ระดับ ที่ ใหญ่ กว่า.
การ ควบคุม การ ปฏิบัติ การ อย่าง ไม่ ถูก ต้อง
การรักษาสภาวะการปฏิบัติการที่มีประสิทธิภาพที่สุดนั้นมีความสําคัญมาก ในระหว่างการปรับขนาด การขยายตัวของอุณหภูมิ ความดัน หรืออัตราการไหลของเลือด อาจส่งผลให้มีประสิทธิภาพในการแยกส่วน
ความ ปลอด ภัย และ สภาพ แวด ล้อม ที่ ดู เหมือน ว่า มี อยู่ ทั่ว ไป
การ กลั่น แกล้ง อาจ นํา มา ซึ่ง ความ เสี่ยง ใหม่ ๆ ทั้ง ใน เรื่อง ความ ปลอด ภัย และ สิ่ง แวด ล้อม.