شہری اینڈمپ؛ اسٹرکچرل انجینئری؛
رنا سیکیشن ٹیکنولوگ میں ٹرانسکرپٹوم اینالیسیس کے لیے ترقیاتی کام
Table of Contents
آر این اے سی سیریز (RNA-seq) نے ری این اے کے مولیکیول کی وسیع تر ساخت اور حروف تہجی کو قابل بنانے سے مرکبات کو تبدیل کر دیا ہے۔اس کے بعد سے ٹیکنالوجی نے ایک دوسرے کے حل تک کی پیمائش کی ہے، مختصر سے لے کر اب تک، مقامی RNA کی معلومات کو براہ راست اور درست طور پر سمجھنے کے لیے، ان میں سے نئے مضمون کی وضاحت کے لیے معلومات کو بہتر بنانے کے لیے،
ایک دوسرے کے ساتھ تعاون کریں
مختصر ریڈ سیکیشن: اعلیٰ کارکردگی اور ایکسچینج کے ذریعے
اگلی نسل کے سکہنگ (این ایس) پلیٹ فارمز، خاص طور پر الینوائے سے آنے والے مختصر رن اے -سیک مارکیٹ پر محیط ہے. [1] Illumana NovaSek] [1] ایک ہی وقت میں ایک ہی بار جاری رہنے کے دوران ایک سو فیصد کی قیمت کو کم کرنے اور پھر سونے کی مقدار کو بہتر بنانے کے لیے مختلف پیمانے پر استعمال کرتے ہیں۔
طویل ریڈ سیکیشن: کپتانی مکمل-لنگتھ ٹرانسپورٹس۔
آکسفورڈ نانوور ٹیکنولوگ اور پاک بائیوسسسس (PacBio) سے طویل ٹیکنالوجیز نے بہت ہی اہم کردار ادا کیا ہے، اب طویل تر 10 کلو بیس فراہم کی ہے. اوکسفورڈ نانپور کے پلیٹ فارم کو اصل میں پیش کرتا ہے اور پرمتھسپس کے لیے یہ مضبوط ترومنگیں تلاوت کرتی ہیں جبکہ 99٪ کے لیے انتہائی پیچیدہ اور انتہائی پیچیدہ طریقے پر مشتمل ہے جنکو اب انتہائی پیچیدہ طریقے سے استعمال کیا جا رہا ہے
تنہا-سیل اور سفوف ٹرانسمیٹرمکس (انگریزی:
تنہا سیل رن اے سیوکنگ: soling Celleler Heterogeneity -
واحد سیل RNA Sequencing (scRNA-seq) جدید میکانیات کا ایک مرکب بن چکا ہے۔
نقلمکانی : اِس کی جگہ پر تیار ہونے والے عطیات
Bulk اور واحد سیل RNA-seq کھونے والی معلومات۔ 10x Visium، سیلائڈ-ساک اور MerrFS وغیرہ جیسے کہ جین ایکسپریس کو پیمائش کرنے کی اجازت دیتے ہیں اب وائرس کے قریب موجود خلیات میں موجود خلیات کے خلیات پر بار کوڈ استعمال کیا جاتا ہے.
براہ راست آر این اے سیوکیشن اور ایپیپنسکریپٹوکس (Epperranscricomics) ہیں۔
ہدایت کار رنوا سیوکنگ : ری میک بیس
روایتی RNA-seq کے لیے دوبارہ سے بحالی کی ضرورت ہوتی ہے، جو بالخصوص 5′′ ختم ہوجانے پر اور GC-rich کے علاقوں میں داخل ہونے والے براہ راست RNA Sequencing, by Republic RNA Malecular, by اپنی تبدیلی کے بغیر. یہ طریقہ کار درستی RNA میں ترمیم، حل پزیر ہوتا ہے اور مکمل طور پر قابلِ عمل طریقے سے تبدیل ہوتا ہے
ڈیٹنگ آر این اے مؤقفات
RNA Malecults میں 170 سے زائد معروف کیمیائی تبدیلیاں ہیں جیسے کہ N6-Mathy liosis (m6A)، Pseudouriden اور 5-thethylcytosin. یہ ترمیمی عملات (servincial) میں ترمیم شدہ غلطیوں یا تناسب (struction) کی شناخت کر سکتے ہیں اور ان کے لیے دیگر کیمیائی عوامل کی وضاحتیں جن میں سے ایک دوسرے کا تعین کیا گیا ہے اور یہ انتہائی تیزی سے اضافہ کرنے کا وعدہ ہے۔
ٹرانسکرپٹممُصامالصوتیس کیلئے بائیونفورمامک آلات
اتحاد اور لیاقت
RNA-Sek data کی دھماکے نے اسپنجاب کے نظام کو ترقی دی ہے. مختصر پڑھنے کے لئے، SPA-Chite-sectors جیسے STR اور TST2 کو تیز اور درست نقشہ فراہم کرتا ہے. Preudiss and Kallisto groundstructions a structions a structions acond.
مختلف ایکسپریس وے اور سپلنگ ایناالیس ہیں۔
مختلف اصطلاحات کے لیے سٹیج طریقے زیادہ استعمال ہو گئے ہیں. ڈرہم 2, and Lymma-vom sound data by settlection, systems, and solve search rates. مختلف تراکیب کے لیے مختلف تراکیب کے لیے اور Ioform کے استعمال کے لیے، RMATS، LeafCet اور Spect کوسپ کے متبادل استعمال کے لیے مشین کو تبدیل کرنے کے ساتھ ساتھ ساتھ ساتھ تبدیل کرنے کے واقعات
کلاؤڈ کمشن اور ریپڈیشن
جدید میکانیات کے پیمانے کو scriptional Company کی ضرورت ہوتی ہے. ری ایکٹر کا عملہ دوکر، sperducificing یا اگلے کیمیائی عمل کا استعمال کرتا ہے. پبلک ری ایکٹرز (CCGA) جیسے کینز جنوم ایٹلس (TCGA) اور EncODE کے تجزیے کے لیے کثیر ڈیٹا بیس فراہم کرتا ہے. مختلف کمپیوٹروں کے ذریعے نتائج کو یقینی بنایا گیا ہے کہ مستقبل میں حیاتیاتی نظام (Boq) میں عام طور پر استعمال کیا جاتا ہے
کلینک اور ترجمے کے اطلاقات
کینسر کی بیماری
RNA-seq وسیع پیمانے پر انوولوجی میں استعمال کیا جاتا ہے تاکہ کیمیائی جنین، سپائیسی اور علاج کی رہنمائی کی جا سکے مثلاً بی سی آر-ایل-ایل-آرG کے طور پر جنین کے اندر موجود خلیات کی تشخیص، ایم ایل آر-اے-آرG کے لیے استعمال کی جا رہی ہے اور اب وہ خون کے بغیر علاج کے قابل استعمال ہو سکتا ہے
رے بیماری کی وجہ سے پیدا ہونے والے حادثات
ٹرانسمیٹر خود کو غیر منظم اور غیر منظم طور پر استعمال کرنے والے امراض میں Expressiomicing Exome یا cequencing کر سکتے ہیں. یہ ابberrant splicing, Monoallic اصطلاحات کی شناخت کر سکتے ہیں اور غیر منظم علاقوں میں pathogenic diseases کی طرف اشارہ کرتے ہیں. بڑے پیمانے پر منصوبے جیسے کہ انگلستان میں Undigazid diseases and Genergy کے واقعات کو مختصر طریقے سے سمجھ میں بے شمار اختصار کے ساتھ حل کیا گیا ہے۔
مشکلات اور مستقبل کی راہنمائی
لاگت اور اسکیلوے
بڑے پیمانے پر قیمتوں میں کمی کے باوجود، معمول RNA-seq بہت سے settlect کے لیے مہنگا رہتا ہے۔ایک دوسرے کے ساتھ جڑے ہوئے جوڑ اور سپائی طریقوں کو معمول کے بڑے پیمانے پر مطالعے کے لیے خرچ کیا جاتا ہے۔
ڈیٹا کمپلیکس اور انٹریکشن
کثیر ال آپس میں حاصل ہونے والے عناصر (mutti-omicstrict) اور مختلف پیمائشی میکانیات (concing struction) کے ساتھ compectics, and epigenomics - are gresserves and machine search search search sssssssssulation as بکثرت کثیر الکلیاتی طبیعیاتی تجزیہ (MOFA) اور گہری سیکھنے کے نمونے اعداد و شمار کی شناخت کر سکتے ہیں۔
ذہنی اور جذباتی طور پر مثالی
AI کو زیادہ سے زیادہ استعمال کیا جاتا ہے hip nernetws space کے نتائج ترتیب سے splicing settlection, classification Subsetts from from medicomboric omerics. اور بڑی زبان کے ماڈلز کو جنو شمارندی ڈیٹا کے لیے (مثلاً DNAB) تک رسائی کا وعدہ ہے (اس طرح) یہ آلات جن کی مدد سے گہری وضاحت اور معلومات کو واضح کرنے کے لیے بڑی تربیتی معلومات حاصل کرنے کے لیے درکار ہیں۔
کُنَّا
RNA Sequencing technology نہایت ہی شاندار رفتار سے آگے بڑھ رہے ہیں. بہتر طور پر مختصر اور طویل خواندگی کے پلیٹ فارمز سے لے کر یک سُست اور سُست طریقے سے اب تحقیق کرنے والوں کے پاس بے حد حد حد تک بے ترتیبی ہے.