انتخاب خط راست سلول برای مطالعات سرطان

خطوط سلول سرطانی چیست؟

خطوط سلول سرطانی جمعیت های فناناپذیری از سلول های مشتق شده از بافت های تومور انسانی هستند، آنها می توانند به طور نامحدود در محیط های آزمایشگاهی کنترل شده منتشر شوند، ارائه یک منبع تجدید پذیر و استاندارد برای تحقیقات زیست پزشکی.12؛ این مدل ها در کشف مکانیسم های مولکولی سرطان، تست اثربخشی دارو و پیشرفت پزشکی شخصی سازی شده نقش اساسی داشته اند.

گام حیاتی برای هر محقق این است که با خط لوله سلول و #8217 مطابقت داشته باشد؛ ویژگی های با سوالات تجربی مورد سوال قرار می گیرد.یک مدل انتخاب ضعیف می تواند منجر به نتایج گمراه کننده، منابع هدر رفته و حتی جمع آوری شود. درک خواص اصلی خطوط سلول های سرطانی اولین گام در انتخاب آگاهانه است.

عوامل کلیدی برای در نظر گرفتن هنگام انتخاب خط سلولی

نوع سرطان و ریشه بافت

اساسی ترین معیار این است که خط سلولی باید از نوع سرطان تحت تحقیقات سرچشمه گیرد، به عنوان مثال، مطالعه سرطان کولورکتال با خط آدنوزینومای ریه (به عنوان مثال، A549) داده های بی ربط مانند مجموعه فرهنگ نوع آمریکایی (ATCC) و مجموعه اروپایی فرهنگ سلول های معتبر (ECACC) داده های دقیق خود را بررسی می کند.

2- ژنتیک و مولکولی پروفایل

تحقیقات مدرن سرطان اغلب جهش های خاص، تغییرات عددی یا نشانه های بیان ژن را هدف قرار می دهد.خط های سلول از ATCC یا پنل NCI 60]، به طور گسترده ای از گیرنده های استروژن استفاده می کنند.

۳- ویژگی های رشد و شرایط فرهنگ

خطوط مختلف سلولی دارای دو برابر زمان، الزامات دلبستگی و وابستگی های سرم هستند. خطوط سریع رشد (به عنوان مثال، HeLa، دو برابر زمان -24 ساعت) برای صفحه نمایش های با ولتاژ بالا مناسب هستند، در حالی که خطوط آهسته تر ممکن است برای مطالعات تمایز بلند مدت ضروری باشد.

۴- اعتبار و وضعیت آلودگی

مسدودسازی صلیب، به ویژه با سلول های HeLa، یک مشکل بدنام است.کمیته بین المللی تأیید اعتبار خط سلول (ICLAC) توصیه می کند که تکرار متناوب (STR) برای تأیید هویت خط لوله سلول، پروفایل های مجدد قابل انکار STR را ارائه می دهند؛ محققان باید سهام خود را در برابر این ارجاعات مقایسه کنند. علاوه بر این، آزمایش برای mycoplasma، که می تواند واکنش های مبتنی بر مواد مخدر یا کیت های تجاری را تغییر دهد.

۵- قابلیت و داده های منتشر شده

خطوط سلولی با سابقه طولانی استفاده اغلب دارای ادبیات غنی از مواد مخدر و داده های ژنومی هستند. MCF-7، به عنوان مثال، در هزاران مطالعه سرطان پستان به کار گرفته شده است، و مقایسه نتایج در سراسر آزمایشگاه ها آسان تر است، اما انتقال سریال می تواند حرکت ژنتیکی را معرفی کند.استفاده از ذخایر کم درآمد از منابع قابل اعتماد و شماره های انتقال اسناد در هر نشریه.

حساسیت به دارو و پروفایل های مقاومت

اگر مطالعه شما شامل شیمی درمانی یا عوامل هدف گذاری، خطوط سلول های پیش نمایش برای حساسیت پایه حیاتی است. پایگاه داده NCI-60 و CancerRxGene منابع فراهم می کند غلظت مهار کننده نیم حداکثری (IC50) برای صدها ترکیبات مقاومت، خطوط جفتوژنیک (در مقابل مجموعه های مقاوم در برابر والدین) و منابع خصوصی در دسترس هستند.

7- ملاحظات اخلاقی و منبع

تمام خطوط سلولی باید با رضایت آگاهانه و نظارت نهادی به دست آمده باشند، بسیاری از خطوط سلولی مدرن، مانند کسانی که از ابتکار مدل های سرطان انسانی (HCMI)، با سابقه دقیق بیمار و تایید اخلاقی مواجه می شوند، از استفاده از خطوط اثبات نشده اجتناب کنند، زیرا ممکن است دارای بدهی های قانونی یا اخلاقی باشند.

خطوط محبوب سرطان توسط نوع بیماری

سرطان پستان

• ]MCF-7: [ [ 0 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ 1 ] [ {\nal A subtype, گیرنده استروژن مثبت, پاسخگو به درمان های endocrine.
• [MDA-MB-231: سه گانه منفی (مانند)، بسیار تهاجمی، اغلب در مطالعات متاستوز استفاده می شود.
• ]T-47D: [ Luminal, پروژسترون مثبت, مناسب برای تحقیقات سیگنال هورمون.

سرطان ریه سرطان ریه

• A549 کارسینوما سلول های غیر کوچک (adenocarcinoma) که به طور گسترده ای برای غربالگری مواد مخدر و سم شناسی استفاده می شود.
• [FLT 1: 1] کارسینوم سلول بزرگ، رشد سریع، مفید برای مدل های ژنوت.
• H1975: جهش EGFR T790M، برای مطالعه مقاومت در برابر مهار کننده های نسل اول EGFR ضروری است.

سرطان رنگی

• ]HT-29 [ [ [ ] [ Microماهواره] با وضوح و تفکیک معتدل، خوب برای آزمایش مواد مخدر.
• [HCT-116] عدم سازگاری، نرخ جهش بالا، ایده آل برای مطالعات ژنتیکی.
• مکانیسم های مقاومت چند دارویی که اغلب در تحقیقات ترکیبی درمانی استفاده می شود.

دیگر خطوط قابل توجه

• [[۱] [۱۰] [۱۰] [۱۰] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱]] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱]] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱]]] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱] [۱
• ]U87MG ] (glioblastoma: به طور معمول در تحقیقات تومور مغز استفاده می شود، اما منشاء و اصالت مورد سوال قرار گرفته است؛ با احتیاط استفاده می شود.
• [FLT 1 ] [FLT: ] [prostate: آندروژن مستقل، بسیار متاستاتیک، استفاده شده برای مطالعات پیشرفته سرطان پروستات.

تایید اعتبار و کنترل کیفیت: گام های غیر قابل مذاکره

یکی از رایج ترین مشکلات در تحقیقات سرطان استفاده از خطوط سلول های آلوده یا نادرست است.یک مطالعه برجسته تخمین زده است که تا ۳۶ درصد از خطوط سلولی از طریق پروتکل تأیید هویت دقیق محافظت از داده ها و اعتبار شما هستند:

• [[۱] [۱۰] [۱۰] [۱۰] [۱۰] [۱۰] [۱۰]] [۱۰] [۱۰] [۱۰] [۱۰]] هر بار که یک جفت جدید در طول دوره طولانی مدت پراکنده و منظم شود.
• تست Mycoplasma [FLT 1] حداقل ماهانه؛ کیت های تجاری PCR حساس و قابل اعتماد هستند.
• با توجه به تغییرات مورفولوژیک [FLT 1] تحت میکروسکوپ فاز-قراردادی ممکن است آلودگی را نشان دهد.
• نگه داشتن یک پایگاه داده خط سلولی [FLT 1] با اعداد عبور، متوسط رشد و نتایج تأیید هویت.

پروتکل های طبیعت دستورالعمل ارائه یک روش استاندارد برای نمایه سازی و گزارش STR.

انتخاب خطوط سلولی برای اهداف تجربی خاص

صفحه نمایش High-Overput Screening

برای کمپین های کشف مواد مخدر، خطوط قوی و سریع رشد با فن آوری های سازگار را انتخاب کنید. پنل NCI-60 اغلب نقطه شروع است.استفاده از خطوط با کیفیت بالا با پاسخ شناخته شده به داروهای استاندارد مراقبتی.

ویرایش ژن و Genomics عملکردی

مطالعات CRISPR-Cas9 نیاز به خطوط سلولی با بهره وری بالا و ظرفیت یکپارچه سازی ژنومیک پایدار دارند. HCT-116 و HEK293T (اگر چه خط سرطانی به طور جداگانه) برای ویرایش خاص سرطان محبوب هستند، خطوط مشتق شده از بیمار را از HCMI در نظر بگیرید.

مدل های Microمحیط و Co-Culture

اگر هدف این است که تعاملات پیش از موعد یا فرار ایمنی را مطالعه کنید، خطوط تک فرهنگ ممکن است کافی نباشد. خطوط استفاده که می تواند با فرمت های فیبروبلاست یا سلول های ایمنی (به عنوان مثال MDA-MB-231 با سلول های فعال T) هماهنگ شده باشد، برخی از خطوط به 3D spheroid یا انداموئید فرمت های بدن، ارائه بافت فیزیولوژیکی بیشتر سازگار شده اند.

روند نوظهور: مدل های بیمار و فرهنگ 3D

در حالی که خطوط تک لایه سنتی 2D همچنان اسب های تحقیقاتی سرطان هستند، آنها اغلب قادر به دفع مجدد در زیست شناسی نورون نیستند. تغییر به سمت ارگانوئیدهای مشتق شده از بیمار (PDOs) و ژنوت ها (PDXs) ارتباط ترجمه بیشتری را ارائه می دهد. PDOs ناهمگنی ژنومی و معماری تومورهای اصلی را حفظ می کند، با این حال آنها را برای پزشکی شخصی سازی می کند و نیاز به شرایط پیچیده تر دارند.

برای آزمایشگاه ها هنوز از خطوط ثابت استفاده می کنند، اتخاذ سیستم عامل های فرهنگی 3D (به عنوان مثال، ماrigel جاسازی، کشیدن قطره) می تواند ارزش پیش بینی کننده آسیس را بهبود بخشد. مطالعات نشان می دهد که پاسخ های دارویی در 3D اغلب با کسانی که در 2D، گاهی اوقات با نتایج بالینی بهتر است، تفاوت دارند.

منابع برای انتخاب خطوط سلولی

چندین پایگاه داده و مخازن می توانند به شناسایی خط سلول بهینه برای پروژه شما کمک کنند:

• و #8211؛ منبع نویسنده با خدمات تأییدیه.
• CancerRxGene و #8211؛ داده های ژنومیک و دارویی برای 1000 خط.
• دایره المعارف (CCLE) و #8211؛ پروفایل های جامع ژنتیکی و حساسیت به مواد مخدر.
• Csaurusello و #8211؛ پایگاه داده های با لینک های متقابل به نشریات و هشدار های آلودگی.

نتیجه گیری

انتخاب خط سلول سرطانی مناسب تصمیم است که از طریق هر آزمایش پایین جریان دوباره تنظیم می شود.این نیاز به هماهنگی دقیق با نوع سرطان، پس زمینه ژنتیکی، رفتار رشد و وضعیت احراز هویت دارد.با استفاده از خطوط به خوبی مشخص شده از منابع معتبر و ترکیب کنترل کیفیت مدرن، محققان می توانند تکثیر و ارتباط بالینی کار خود را افزایش دهند، زیرا این زمینه به سمت پیشرفت های پیچیده تر مهارت های ضروری برای انتخاب درمان سرطان و پایدار ادامه می دهد.

زمان را در تأیید هویت و ویژگی های خط سلولی قبل از انجام مطالعات بزرگ در مقیاس بزرگ سرمایه گذاری کنید.با مدل مناسب در دست، تحقیقات شما به احتمال زیاد نتایج قابل اعتماد و موثر را تولید می کند که در نهایت به بیماران سود می رساند.