پیشرفت های اخیر در ژنومیک ها نشان می دهد که چگونه محققان و پزشکان به سرطان های نادر نزدیک می شوند - بدخیمی که هر ساله کمتر از ۲۰۰،۰۰۰ نفر در ایالات متحده را تحت تاثیر قرار می دهد، زیرا این سرطان ها بی نظیر هستند، آنها از لحاظ تاریخی کمتر تحقیق می کنند و گزینه های درمان اغلب پشت آن برای تومورهای رایج تر قرار می گیرند. Genomics، مطالعه جامع یک ارگانیسم کامل شناسایی DNA، که در حال حاضر به طور مستقیم به بررسی این روش های ژنتیکی دقیق و دقیق آن اشاره می کند.

نقش ژنومیک در باز کردن زیست شناسی سرطان Rare

ژنوم دانشمندان را قادر می سازد تا کل کد ژنتیکی تومور را بخوانند (نه تنها چند ژن بلکه ژنوم یا کل را با مقایسه DNA سلول های سرطانی با سلول های سالم از همان بیمار، محققان می توانند جهش های دارویی را که به طور معمول به ژن های بدخیمی اشاره می کنند، مشخص کنند، که در آن دسته بندی های مسیر معمول ممکن است مطالعات کمی را ارائه دهند، این پروفایل مولکولی می تواند آسیب پذیری های غیر منتظره (FISTF) را به طور مستقیم تشخیص دهد.

تکنولوژی های پیشرفته توالی یابی پیشرفته

سیستم عامل های توالی نسل بعدی (NGS) به طور چشمگیری هزینه را کاهش داده و سرعت تجزیه و تحلیل ژنوم را افزایش داده اند. توالی کل-exome (WES) مناطق کدگذاری پروتئین را می خواند - در حدود 1 تا 2 درصد از ژنوم - که در آن اکثر جهش های سرطان زا یافت می شوند.

شناسایی موتئات ژنتیکی

هدف اولیه تجزیه و تحلیل ژنومیک در سرطان های نادر، شناسایی جهش هایی است که می تواند توسط داروهای موجود مورد هدف قرار گیرد یا به سمت توسعه اثر انگشت جدید شناخته شده (FLT:0TP53[۱] [FLT1] و KRAS [FLT3]، که در سرطان های مکرر شناخته شده رایج تر است، اغلب نشان می دهد که DNA های منحصر به فرد (FOTA) هستند، به فرد، به فرد است.

از Mutation تا Targeted Therapy: Pathways توسعه

هنگامی که یک جهش راننده در یک سرطان نادر تایید می شود، مسیر درمان هدفمند شامل چندین مرحله است: پیش بالینی، طراحی دارو یا تزریق مجدد، و آزمایش بالینی.از آنجا که سرطان های نادر جمعیت بیمار کوچک دارند، آزمایشات تصادفی سنتی اغلب غیر قابل درک هستند، به جای آن، سازمان های نظارتی مانند FDA ممکن است داده ها را از کارآزمایی های تک سلاح یا تجزیه و تحلیل های ترکیبی از انواع نادر تومور بپذیرند.

هدف مستقیم پروتئین های موتated

بسیاری از درمان های هدفمند مولکول های کوچکی هستند که برای جلوگیری از پروتئین غیر طبیعی تولید شده توسط یک ژن جهش یافته (به عنوان مثال، {FLT:0BRAF V600E طراحی شده اند که در چندین سرطان نادر از جمله سلول های موکفی، بیماری Erenoheim-Chester و برخی از ملانوما های مختلف، به طور موثر توسط داروهایی که توسط فیبروفنووئیدهای معمول درمان می شوند، مسدود می شوند.

بازگشت مواد مخدر موجود

از آنجا که توسعه دارو برای یک ترکیب جدید گران و وقت گیر است، مصرف مجدد مواد مخدر که قبلا برای سایر نشانه ها تایید شده است، یک استراتژی عملی برای سرطان های نادر است.اگر پروفایل ژنومیک نشان دهنده یک جهش است که به طور معمول به یک داروی خاص در یک سرطان رایج پاسخ می دهد، همان دارو می تواند در سرطان نادر آزمایش شود.

چالش های درمان Genomics-Driven برای سرطان های نادر

علی رغم وعده، استفاده از ژنومیک برای درمان سرطان های نادر بدون موانع است.سه چالش اصلی غالب است: نمونه و کمبود داده، ناهمگنی تومور و هزینه های بالا.

اندازه های محدود

با تعداد کمی از بیماران، جمع آوری داده های ژنومی کافی برای شناسایی جهش های تکراری دشوار است.[۱] جهشی که تنها در ۱ درصد از یک سرطان رایج رخ می دهد، ممکن است هنوز هم هزاران بیمار را نشان دهد، اما در یک سرطان نادر، همان ویژگی های مشابه به تعداد انگشت شماری از افراد مبتلا می شود، این امر باعث می شود که ثابت کند که یک جهش خاص واقعاً راننده است و نه یک کارمند همکاری متقابل بین المللی، مانند ادغام اطلاعات کوچک از سوی دستگاه های ذخیره سازی شده است.

رشد Heterogeneity

حتی در یک نوع سرطان نادر، تومورها ممکن است از نظر ژنتیکی متنوع باشند. [برای مثال، rhabdomyosarcomas شامل زیرنوع هایی با PAX3/7 -FOXO1 ترکیب و همچنین اشکال تکراری که توسط جهش های متمایز هدایت می شوند، این ناهمگنی به این معنی است که یک زیرمجموعه درمان هدفمند برای یک فرد ممکن است برای نظارت بر روی درمان های جدید به کار نکند، بنابراین می تواند به عنوان درمان های ضد میکروبی و درمان های مکرر به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مکرر، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مکرر، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به عنوان درمان های مشابه، به طور معمول، به عنوان درمان های مختلف، به طور جداگانه، به طور جداگانه ای که تحت درمان های مختلف، به طور معمول، به طور جداگانه ای که تحت درمان های مختلف، به طور معمول، به طور معمول، به طور معمول، به طور معمول، به طور مکرر، به طور مکرر، به طور معمول، به صورت جداگانه ای که تحت درمان های مشابه،

هزینه و دسترسی

توالی کل اسکلت تومور یا ژنوم هنوز چندین هزار دلار هزینه دارد و تمام سیستم های بهداشتی آن را پوشش نمی دهند، بسیاری از بیماران سرطانی نادر در بیمارستان های اجتماعی که فاقد زیرساخت های تست ژنومیک هستند، درمان می شوند و تلاش برای کاهش هزینه ها، مانند پانل های ژن هدفمند که تنها شامل قابل اجراترین جهش ها هستند، کمک می کنند، اما ایده آل دسترسی گسترده به پروفایل های جامع و سازمان های پوشش غیر انتفاعی است، برنامه های رایگان و پشتیبانی می شود.

راهنمایی های آینده: پزشکی دقیق برای همه سرطان های نادر

دهه بعد وعده می دهد که ادغام ژنومیک ها را به مراقبت های روزمره برای سرطان های نادر تسریع کند. چندین روند برای این امکان پذیر شدن هستند.

ادغام با ایمونوتراپی

ژنومیک همچنین در اطلاع رسانی به استراتژی های ایمنی درمانی برای سرطان های نادر است.توم ها با یک بار جهش بالا اغلب به مهار کننده های بازرسی پاسخ می دهند و پروفایل ژنومیک می تواند این موارد را شناسایی کند، به عنوان مثال، برخی از سرطان های نادر ناشی از کمبود ناسازگار ترمیم بالینی، مانند زیرمجموعه ای از سارکوم، به شدت حساس به آزمایش های پدیلیوم هستند.

اصلاح ژن و تغییر جایگزین

فن آوری هایی مانند CRISPR-EW9 امکان اصلاح مستقیم جهش های راننده را باز می کنند، اگرچه این امر عمدتاً پیش بالینی است.برای سرطان های نادر با یک علت ژنتیکی تک، به خوبی تعریف شده، مانند جهش های ژنتیکی خاص در سطح میکروب ها (FLT:0BRCA1/2 که پیش از آن به سرطان های نادر تخمدان مبتلا می شوند، ویرایش ژن می تواند یک روز درمان سریع تر کند.

هوش مصنوعی در ژنومی سرطان نادر

الگوریتم های یادگیری ماشین برای تفسیر مقدار زیادی از داده های ژنومی تولید شده از تومورهای نادر ضروری می شوند. AI می تواند جهش هایی را برای تست های عملکردی اولویت بندی کند، حساسیت به مواد مخدر را بر اساس الگوهای مولکولی پیش بینی کند و حتی درمان های ترکیبی را پیشنهاد می کند که هم محرک اصلی و هم به احتمال زیاد مقاومت پزشکان را برای استفاده از پایگاه های (FLT:0 OncoKB[F1 و [F:2] [CI2] فراهم می کند.

نتیجه گیری

ژنوم ها اساسا چشم انداز بیماران سرطانی نادر را تغییر داده اند، به جای اینکه به پیش آگهی دقیق و مبهم با گزینه های معدودی استعفا دهند، بسیاری از آنها اکنون می توانند درمان های طراحی شده برای حمله به ضعف های ژنتیکی خاص تومورهای خود را دریافت کنند. داستان های موفقیت - ماتینib برای GIST، لاروtrectinib برای درمان سی ان ایمونوی مثبت NTRK و بسیاری دیگر - با وجود چالش های سرمایه گذاری منحصر به فرد در مورد کاهش داده های بالینی، می تواند از اثرات موثر در ادامه دهد.